Институт является научно-исследовательским комплексом, входит в состав Отделения общей биологии НАН Украины и является базовой организацией Океанологического центра НАН Украины. В структуру Института входят: Одесский филиал, Карадагская биологическая станция, 13 научно-исследовательских отделов, аквариум-музей, научно-вспомогательные подразделения.
В целом в ИнБЮМ НАН Украины, включая его отделение и другие подразделения, работают 343 человека, в т.ч. 3 академика и 2 чл.-корр. НАН Украины, 16 докторов наук, 84 кандидата наук.
Основные направления исследований
ИнБЮМ НАН Украины:
1. Изучение механизмов адаптации, трансформации и эволюции морских систем в условиях климатических изменений и антропогенного воздействия
2. Решение гидробиологических и биотехнических проблем интегрированного управления прибрежными зонами с целью рационального использования природных ресурсов, экологической реабилитации устойчивого развития.
3. Создание методов и технологий оперативного контроля экологического состояния биоты, оценка и прогноз качества морской среды наравне экологического риска в зонах активного мореиспользования.
4. Исследование биологического разнообразия Черноморско-Азовского бассейна и разработка эффективных мероприятий для его сохранения.
Сегодня Институт, являясь ведущим научным учреждением по вопросам сохранения морской окружающей среды, устойчивого развития и биоразнообразия, разрабатывает актуальнейшие проблемы мировой науки по созданию новых технологий охраны
окружающей среды и воспроизводства биологических ресурсов.
Институт является Операционным центром Международного института океана в Украине (МИО),
главным офисом Международного Союза по Экоэтике.